この記事を書いている段階では、JDK1.4.1が最新JDKですが、幸いなことに、JDK1.4以降から、ImageI/O というAPIが用意されました。基本的には、これを使用するのがよいと思います。

　ただ、残念ながら、2002年12月現在、ImageI/Oでは、GIFでの書き込みを標準ではサポートしていません。(GIF対応のプラグインを追加する必要がありますが、私の知る限りでは、まだ対応プラグインは出ていません。)
　これは、米Unisys社保有のLZW圧縮特許がGIF形式画像の生成に利用されているためと思われます。
　私の記憶が確かであれば、2003年ごろ、この特許が期限切れになるはずですので、来年の終わりくらいには、事情も変わっているかもしれません。
　つまり、JDKの標準APIだけで、画像を出力するのであれば、JPEG　/ PNG　形式を利用することになります。
　確かに3年くらい前だと、ブラウザのPNG対応が不完全だったりもしましたが、最近は、事情が変わってきていますので、個人サイトレベルであれば、思い切って導入してもいいのではないかと思います。

　古いブラウザのPNG対応については、COCKYさんが詳しくまとめてらっしゃいますので参照してください。
　COCKYさんの表に入っていない新しいブラウザでは、ほぼ対応しています。

　また、その昔は、ACME Laboratories で公開されている、Acme.JPM.Encoders.GifEncoder を使用してGIFを生成していたケースもあったようです。

• 入出力サンプル
  
  　以下のコードは、ReadSample.gif ファイルを読み込んで、WriteSample.png に変換し、保存します。
  　いたって簡単です。
  
  

  import javax.imageio.ImageIO;
  import java.awt.image.BufferedImage;
  import java.io.File;
  class ImageIOFormatConversion {
     public static void main(String[] args) throws Exception {
       BufferedImage bi = ImageIO.read(new File("ReadSample.gif"));
       ImageIO.write(bi, "png", new File("WriteSample.png"));
     }
  }
  
  
  

• カスタムグラフィックを動的生成してPNGで保存する
  
  　自作のカスタムグラフィックをPNGで保存する場合は、上のコードの画像読み込み部分が、画像生成コードに置き換わる形になります。
  　具体的には、BufferedImage を生成して、そこにJava2Dなどで描画し、それをImageI/Oで保存するだけです。
  　Java2Dについては、次のセクションを参照してください。